ใครค้นพบโครงสร้างของไรโบโซม

เนื้อหา

• TL; DR (ยาวเกินไปไม่ได้อ่าน)
• คำอธิบายของ Ribosomes
• ความชุกของไรโบโซม
• ไรโบโซมเป็นโรงงานโปรตีน
• ผู้ค้นพบไรโบโซม
• การค้นพบโครงสร้างของไรโบโซม
• Ribozyme คืออะไร?
• การจัดหมวดหมู่ไรโบโซมตามค่า Svedberg
• ความสำคัญของโครงสร้างของ Ribosome

ไรโบโซมเรียกได้ว่าเป็นผู้สร้างโปรตีนของเซลล์ทั้งหมด โปรตีนควบคุมและสร้างชีวิต

ดังนั้นไรโบโซมจึงมีความสำคัญต่อชีวิต แม้จะมีการค้นพบของพวกเขาในปี 1950 มันใช้เวลาหลายสิบปีกว่าที่นักวิทยาศาสตร์จะอธิบายโครงสร้างของไรโบโซมอย่างแท้จริง

TL; DR (ยาวเกินไปไม่ได้อ่าน)

จอร์จอี. พาเลดค้นพบเป็นครั้งแรกในเมืองไรโบโซมซึ่งเป็นโรงงานผลิตโปรตีนของทุกเซลล์ อย่างไรก็ตามโครงสร้างของไรโบโซมถูกกำหนดมาหลายทศวรรษต่อมาโดย Ada E Yonath, Thomas A. Steitz และ Venkatraman Ramakrishnan

คำอธิบายของ Ribosomes

ริโบโซมได้ชื่อมาจาก“ ริโบ” ของกรดริบอนนิวคลีอิก (RNA) และ“ โซมา” ซึ่งเป็นภาษาละตินสำหรับ“ ร่างกาย”

นักวิทยาศาสตร์นิยามไรโบโซมเป็นโครงสร้างที่พบในเซลล์ซึ่งเป็นหนึ่งในหลาย ๆ เซลล์ย่อยที่เรียกว่า organelles. ไรโบโซมมีสองหน่วยย่อยหนึ่งใหญ่และเล็กหนึ่งแห่ง นิวเคลียสทำหน่วยย่อยเหล่านี้ซึ่งล็อคเข้าด้วยกัน Ribosomal RNA และโปรตีน (riboproteins) ทำขึ้นเป็นไรโบโซม

ไรโบโซมบางตัวจะลอยอยู่ในไซโตพลาสซึมของเซลล์ในขณะที่บางชนิดจะยึดติดกับเอนโดพลาสซึมเรติคัล (ER) เอนโดพลาสซึม reticulum studded กับไรโบโซมเรียกว่า ร่างแหเอนโดพลาสมาแบบหยาบ (RER); reticulum เอนโดพลาสซึมเรียบ (SER) ไม่มีไรโบโซมติดอยู่

ความชุกของไรโบโซม

เซลล์สามารถมีไรโบโซมหลายพันหรือหลายล้านเซลล์ขึ้นอยู่กับสิ่งมีชีวิต ไรโบโซมมีอยู่ในเซลล์ทั้งโปรคาริโอตและยูคาริโอต พวกมันยังสามารถพบได้ในแบคทีเรียไมโตคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ ไรโบโซมเป็นที่แพร่หลายมากขึ้นในเซลล์ที่ต้องการการสังเคราะห์โปรตีนอย่างต่อเนื่องเช่นสมองหรือเซลล์ตับอ่อน

ไรโบโซมบางตัวอาจมีขนาดค่อนข้างใหญ่ ในยูคาริโอตพวกมันสามารถมีโปรตีน 80 ชนิดและทำจากอะตอมหลายล้านตัว ส่วนอาร์เอ็นเอของพวกเขารับมวลมากกว่าส่วนโปรตีนของพวกเขา

ไรโบโซมเป็นโรงงานโปรตีน

ไรโบโซมใช้ codonsซึ่งเป็นชุดของนิวคลีโอไทด์สามชนิดจาก messenger RNA (mRNA) โคดอนทำหน้าที่เป็นแม่แบบจาก DNA ของเซลล์เพื่อสร้างโปรตีน จากนั้นริโบโซมก็แปลโคดอนและจับคู่มันกับกรดอะมิโน โอน RNA (tRNA) สิ่งนี้เรียกได้ว่า การแปล.

ไรโบโซมมีไซต์การเชื่อมโยงสาม tRNA: aminoacyl เว็บไซต์ที่มีผลผูกพัน (เว็บไซต์) สำหรับการแนบกรดอะมิโน, peptidyl ไซต์ (ไซต์ P) และ ทางออก ไซต์ (ไซต์ E)

หลังจากกระบวนการนี้กรดอะมิโนที่แปลแล้วสร้างขึ้นบนโซ่โปรตีนที่เรียกว่า polypeptideจนกระทั่งไรโบโซมทำงานจนเสร็จสมบูรณ์ในการสร้างโปรตีน เมื่อโพลีเปปไทด์ถูกปล่อยสู่ไซโตพลาสซึมมันก็จะกลายเป็นโปรตีนที่ใช้งานได้ กระบวนการนี้เป็นเหตุผลว่าทำไมไรโบโซมจึงถูกกำหนดให้เป็นโรงงานโปรตีน การผลิตโปรตีนสามขั้นตอนเรียกว่าการเริ่มต้นการยืดตัวและการแปล

ไรโบโซมแบบแมชชีนเหล่านี้ทำงานได้อย่างรวดเร็วติดกับกรดอะมิโน 200 ตัวต่อนาทีในบางกรณี โปรคาริโอตสามารถเพิ่มกรดอะมิโน 20 ตัวต่อวินาที โปรตีนที่ซับซ้อนต้องใช้เวลาไม่กี่ชั่วโมงในการรวบรวม ไรโบโซมทำมากที่สุดของโปรตีนประมาณ 10 พันล้านเซลล์ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม

โปรตีนที่สมบูรณ์อาจส่งผลต่อการเปลี่ยนแปลงหรือการพับ สิ่งนี้เรียกว่า การดัดแปลงหลังการแปล. ในยูคาริโอต เครื่อง Golgi ทำโปรตีนให้เสร็จก่อนปล่อยออกมา เมื่อไรโบโซมทำงานเสร็จแล้วหน่วยย่อยของพวกเขาจะถูกนำไปรีไซเคิลหรือรื้อถอน

ผู้ค้นพบไรโบโซม

George E. Palade ค้นพบไรโบโซมครั้งแรกในปี 2498 คำอธิบายไรโบโซมของ Palade แสดงให้เห็นว่าเป็นอนุภาคไซโตพลาสซึมที่เกี่ยวข้องกับเยื่อหุ้มเซลล์ของเอนโดพลาสซึม Palade และนักวิจัยอื่น ๆ พบว่าการทำงานของไรโบโซมซึ่งเป็นการสังเคราะห์โปรตีน

ฟรานซิสคริกจะทำต่อในรูปแบบ ความเชื่อหลักของชีววิทยาซึ่งสรุปกระบวนการสร้างชีวิตในฐานะ“ DNA ทำให้ RNA สร้างโปรตีน”

ในขณะที่รูปร่างทั่วไปถูกกำหนดโดยใช้ภาพกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนมันต้องใช้เวลาอีกหลายทศวรรษกว่าจะพิจารณาโครงสร้างที่แท้จริงของไรโบโซม นี่เป็นสาเหตุส่วนใหญ่มาจากขนาดที่ใหญ่โตของไรโบโซมซึ่งยับยั้งการวิเคราะห์โครงสร้างในรูปแบบคริสตัล

การค้นพบโครงสร้างของไรโบโซม

ในขณะที่ Palade ค้นพบไรโบโซมนักวิทยาศาสตร์คนอื่น ๆ ก็กำหนดโครงสร้างของมัน นักวิทยาศาสตร์สามคนแยกค้นพบโครงสร้างของไรโบโซม: Ada E Yonath, Venkatraman Ramakrishnan และ Thomas A. Steitz นักวิทยาศาสตร์สามคนนี้ได้รับรางวัลโนเบลสาขาเคมีในปี 2552

การค้นพบโครงสร้างไรโบโซมสามมิติเกิดขึ้นในปี 2000 โยนาถเกิดในปี 1939 เปิดประตูสำหรับการเปิดเผยนี้ งานเริ่มต้นของเธอในโครงการนี้เริ่มขึ้นในปี 1980 เธอใช้จุลินทรีย์จากน้ำพุร้อนเพื่อแยกไรโบโซมเนื่องจากธรรมชาติที่แข็งแกร่งในสภาพแวดล้อมที่เลวร้าย เธอสามารถตกผลึกของไรโบโซมได้ดังนั้นพวกเขาจึงสามารถวิเคราะห์ผ่านการทำผลึก X-ray

สิ่งนี้สร้างรูปแบบของจุดบนเครื่องตรวจจับเพื่อให้สามารถตรวจพบตำแหน่งของ ribosomal atoms ในที่สุด Yonath ผลิตผลึกคุณภาพสูงโดยใช้ cryo-crystallography ซึ่งหมายความว่าผลึกไรโบโซมนั้นถูกแช่แข็งเพื่อช่วยป้องกันไม่ให้แตกหัก

นักวิทยาศาสตร์พยายามที่จะอธิบาย“ มุมเฟส” สำหรับรูปแบบของจุด เมื่อเทคโนโลยีได้รับการปรับปรุงการปรับแต่งขั้นตอนนำไปสู่รายละเอียดในระดับอะตอมเดี่ยว Steitz เกิดในปี 1940 สามารถค้นพบว่าขั้นตอนการทำปฏิกิริยาเกี่ยวข้องกับอะตอมใดที่เชื่อมต่อกับกรดอะมิโน เขาพบข้อมูลเฟสสำหรับหน่วยขนาดใหญ่ของไรโบโซมในปี 1998

Ramakrishan เกิดในปี 1952 ในทางกลับกันทำงานเพื่อแก้ไขขั้นตอนการเลี้ยวเบนของรังสีเอกซ์สำหรับแผนที่โมเลกุลที่ดี เขาพบข้อมูลเฟสสำหรับหน่วยย่อยขนาดเล็กของไรโบโซม

ทุกวันนี้ความก้าวหน้าต่อไปของผลึกไรโบโซมเต็มรูปแบบได้นำไปสู่การแก้ไขโครงสร้างที่ซับซ้อนของไรโบโซมได้ดีขึ้น ในปี 2010 นักวิทยาศาสตร์ประสบความสำเร็จในการสกัดริโบโซม 80S ของยูคาริโอต Saccharomyces cerevisiae และสามารถแมปโครงสร้างเอ็กซ์เรย์ ("80S" เป็นประเภทของการจำแนกประเภทที่เรียกว่าค่า Svedberg; อีกไม่นานนี้) สิ่งนี้จะนำไปสู่ข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับการสังเคราะห์และการควบคุมโปรตีน

ไรโบโซมของสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นวิธีที่ง่ายที่สุดในการทำงานกับโครงสร้างของไรโบโซม นี่เป็นเพราะไรโบโซมเองนั้นมีขนาดเล็กและซับซ้อนน้อยกว่า จำเป็นต้องมีการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อกำหนดโครงสร้างของไรโบโซมของสิ่งมีชีวิตที่สูงขึ้นเช่นที่อยู่ในมนุษย์ นักวิทยาศาสตร์หวังว่าจะได้เรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับโครงสร้างไรโบโซมของเชื้อโรคเพื่อช่วยในการต่อสู้กับโรค

Ribozyme คืออะไร?

ระยะเวลา ribozyme หมายถึงหน่วยย่อยขนาดใหญ่สองแห่งของไรโบโซม ribozyme ทำหน้าที่เป็นเอนไซม์ดังนั้นชื่อของมัน มันทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการประกอบโปรตีน

การจัดหมวดหมู่ไรโบโซมตามค่า Svedberg

ค่า Svedberg (S) อธิบายอัตราการตกตะกอนในเครื่องปั่นแยก นักวิทยาศาสตร์มักอธิบายหน่วยไรโบโซมโดยใช้ค่า Svedberg ตัวอย่างเช่นโปรคาริโอตมีไรโบโซม 70S ซึ่งประกอบด้วยหนึ่งยูนิตที่มี 50S และหนึ่งใน 30S

สิ่งเหล่านี้ไม่ได้เพิ่มขึ้นเนื่องจากอัตราการตกตะกอนเกี่ยวข้องกับขนาดและรูปร่างมากกว่าน้ำหนักโมเลกุล ในขณะที่เซลล์ยูคาริโอตมีไรโบโซม 80S

ความสำคัญของโครงสร้างของ Ribosome

ไรโบโซมมีความสำคัญต่อทุกชีวิตเพราะโปรตีนเหล่านี้สร้างความมั่นใจในชีวิตและการสร้างบล็อก โปรตีนที่จำเป็นสำหรับชีวิตมนุษย์ ได้แก่ ฮีโมโกลบินในเซลล์เม็ดเลือดแดงอินซูลินและแอนติบอดี

เมื่อนักวิจัยเปิดเผยโครงสร้างของไรโบโซมมันก็เปิดโอกาสใหม่สำหรับการสำรวจ แนวทางหนึ่งในการสำรวจคือการใช้ยาปฏิชีวนะใหม่ ตัวอย่างเช่นยาใหม่อาจหยุดโรคด้วยการกำหนดเป้าหมายองค์ประกอบโครงสร้างบางอย่างของไรโบโซมของแบคทีเรีย

ด้วยโครงสร้างของไรโบโซมที่ค้นพบโดย Yonath, Steitz และ Ramakrishnan ตอนนี้นักวิจัยทราบตำแหน่งที่แม่นยำระหว่างกรดอะมิโนและตำแหน่งที่โปรตีนออกจากไรโบโซม การคำนึงถึงสถานที่ที่ยาปฏิชีวนะติดอยู่กับไรโบโซมจะช่วยเพิ่มความแม่นยำในการออกฤทธิ์ของยา

สิ่งนี้สำคัญมากในยุคที่ยาปฏิชีวนะกำยำก่อนหน้านี้เคยพบกับแบคทีเรียสายพันธุ์ที่ดื้อยาปฏิชีวนะ การค้นพบโครงสร้างไรโบโซมจึงมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการแพทย์