ฟังก์ชั่นของเอ็นไซม์ Ligase ในการขึ้นรูปดีเอ็นเอรีคอมบิแนนท์คืออะไร?

Posted on
ผู้เขียน: Louise Ward
วันที่สร้าง: 10 กุมภาพันธ์ 2021
วันที่อัปเดต: 19 พฤศจิกายน 2024
Anonim
เอนไซม์ ชีวเคมี
วิดีโอ: เอนไซม์ ชีวเคมี

เนื้อหา

งานส่วนใหญ่ที่ทำในเซลล์สิ่งมีชีวิตนั้นทำโดยโปรตีน สิ่งหนึ่งที่เซลล์ต้องทำคือทำสำเนาดีเอ็นเอของมัน

ตัวอย่างเช่นในร่างกายของคุณ DNA นั้นซ้ำซากหลายล้านล้านครั้ง โปรตีนทำหน้าที่ดังกล่าวและโปรตีนหนึ่งในนั้นคือเอนไซม์ที่เรียกว่า DNA ligase. นักวิทยาศาสตร์ยอมรับว่า ligase อาจมีประโยชน์ในการสร้าง DNA recombinant ในห้องปฏิบัติการดังนั้นพวกเขาจึงรวมขั้นตอน ligation เข้ากับกระบวนการสร้าง recombinant DNA

โครงสร้างของดีเอ็นเอ

ดีเอ็นเอของสายเดี่ยวประกอบด้วยลำดับของฐานไนโตรเจนที่ผ่านตัวย่อ A, T, G และ C โดยปกติแล้ว DNA จะพบได้ในเส้นคู่สองเส้นที่เรียงลำดับความยาวหนึ่งฐานเข้าคู่กับเส้นที่มีความยาวเท่ากัน ฐาน

ทั้งสองเส้นเป็นส่วนประกอบในที่ที่หนึ่งสายมีอีกอันมี T และที่หนึ่งมี G อื่น ๆ มี C. A และ T จับคู่กันผ่านพันธะเคมีอ่อนแอเรียกว่าพันธะไฮโดรเจน และ G และ C ทำเช่นเดียวกัน

พรึบทั้งสองเส้นเสริมเข้าด้วยกันผ่านพันธะไฮโดรเจนจำนวนมาก แต่ละเส้นสองเส้นแต่ละเส้นยึดฐานนิวเคลียร์ของตัวเองพร้อมกับพันธะที่แข็งแกร่งในรูปของกลุ่มน้ำตาลและฟอสเฟตที่มีสายยาว

ฟังก์ชัน Ligase

คุณสามารถนึกถึงสายเกลียว DNA เป็นสร้อยข้อมือที่มีเสน่ห์ยาวชนิดหนึ่งที่มีมนต์เสน่ห์สี่แบบ เสน่ห์เพียงห้อยออกจากห่วงโซ่ที่แข็งแกร่งที่เชื่อมต่อพวกเขาเข้าด้วยกัน

การจำลองดีเอ็นเอสร้างกำไลเสน่ห์อีกอันที่จับคู่กับอันแรก เมื่อใดก็ตามที่มีเสน่ห์ A บนสร้อยข้อมือแรก, เสน่ห์ T จะพอดีกับสร้อยข้อมือที่สองและเหมือนกันสำหรับ C และ G

เสน่ห์ของสร้อยข้อมือที่สองสามารถจับคู่กับสร้อยข้อมือแรกโดยไม่ต้องอยู่กับสร้อยข้อมือตัวเอง นั่นคือพวกเขาสามารถเชื่อมต่อกับโซ่ตรงข้ามผ่านการเชื่อมต่อที่อ่อนแอโดยไม่ต้องมีห่วงโซ่ที่แข็งแกร่งเพื่อเชื่อมต่อพวกเขากับเพื่อนบ้าน

เอนไซม์ DNA ligase ตรวจจับสถานที่ที่น้ำตาลและฟอสเฟตโซ่ถูกทำลายและสร้างการเชื่อมโยงเชื่อมโยงกลุ่มน้ำตาลและฟอสเฟตเข้าด้วยกัน

ดีเอ็นเอรีคอมบิแนนต์

Recombinant DNA เป็นผลมาจากการตัดสายเกลียวคู่ของ DNA และเชื่อมต่อกับสายคู่อื่น แต่ละเกลียวคู่นั้นมักจะถูกตัดอย่างไม่สม่ำเสมอโดยมีเส้นหนึ่งเส้นที่ลงท้ายด้วยอีกไม่กี่เส้น

ยกตัวอย่างเช่นมีฐานพิเศษห้อยอยู่ปลายด้านหนึ่งเช่นเดียวกับใน TTAA สาระคู่อื่น ๆ มีฐานพิเศษในลำดับเช่น AATT ฐานพิเศษสองชุด - เรียกว่า "ปลายเหนียว" - จับกันผ่านพันธะไฮโดรเจนที่อ่อนแอ

ลองนึกภาพกำไลเสน่ห์อีกครั้งจินตนาการว่าคุณมีสร้อยข้อมือคู่เสน่ห์คู่ที่มีสองโซ่เชื่อมต่อผ่านเสน่ห์ของพวกเขาเท่านั้น คุณตัดออกจากปลาย แต่คุณตัดปลายด้านหนึ่งของสี่เสน่ห์สั้น ๆ ของอื่น ๆ ดังนั้นมีหางเล็ก ๆ น้อย ๆ ห้อยออก

คุณทำสิ่งเดียวกันกับสร้อยข้อมือ Charm คู่อื่น หากเครื่องรางสี่ชิ้นเสริมซึ่งกันและกันทั้งสองเครื่องรางที่ถูกสนิปจะเชื่อมต่อ แต่ผ่านทางเครื่องรางของพวกเขาเท่านั้น

เอ็นไซม์ Ligase ที่ใช้ในการคืนสภาพ

ในขั้นตอนก่อนหน้าของการรวมตัวกันอีกครั้งดีเอ็นเอปลายเหนียวจับคู่ของโมเลกุลดีเอ็นเอสองเส้นที่แตกต่างกันมีการเชื่อมต่อขึ้น อย่างไรก็ตามการเชื่อมต่อระหว่างสองส่วนเท่านั้นคือผ่านพันธบัตรที่อ่อนแอ เช่นเดียวกับสร้อยข้อมือ Charm ที่เชื่อมต่อผ่านทางเสน่ห์ที่ตรงกันเท่านั้นมันจะง่ายที่จะดึงพวกมันออกจากกัน

เอนไซม์ DNA ligase ค้นหาสถานที่ที่กลุ่มน้ำตาลและฟอสเฟตไม่ได้เชื่อมต่อเข้าด้วยกันและมันเชื่อมโยงพวกมันเข้าด้วยกัน เช่นเดียวกับสร้อยข้อมือที่มีเสน่ห์หลังจากที่ DNA ligase ผ่านเข้ามาและเชื่อมโยงฐานเข้าด้วยกันโมเลกุล DNA ใหม่ที่ยาวและยาวขึ้นจะเชื่อมต่อกันอย่างแน่นหนา