วิธีการสร้างแบบจำลองดีเอ็นเอจากลูกปัดและหลอด

Posted on
ผู้เขียน: Randy Alexander
วันที่สร้าง: 23 เมษายน 2021
วันที่อัปเดต: 15 พฤศจิกายน 2024
Anonim
พวงกุญแจDNA
วิดีโอ: พวงกุญแจDNA

เนื้อหา

แบบจำลองของ Deoxyribonucleic acid (DNA) เริ่มต้นด้วยภาพการเลี้ยวเบนของ X-ray ที่ถ่ายโดย Rosalind Franklin รูปถ่ายของเธอช่วยให้ Francis Crick และ James Watson สร้าง DNA ต้นแบบสามมิติที่สมบูรณ์ซึ่งเป็นเกลียวคู่ที่มีชื่อเสียงในขณะนี้

ในขณะที่รุ่นของ DNA สามารถซื้อได้การสร้างแบบจำลองช่วยให้เข้าใจโครงสร้าง

แบบจำลองเกลียวคู่ดีเอ็นเอ

แบบจำลองเกลียวคู่ดีเอ็นเอประกอบด้วยหกส่วน กระดูกสันหลังหรือด้านข้างของแบบจำลองประกอบด้วยโมเลกุลฟอสเฟตสลับกับโมเลกุล Deoxyribose ฐานไนโตรเจนของโมเลกุล DNA จะเชื่อมต่อกับโมเลกุล Deoxyribose เท่านั้นไม่ใช่โมเลกุลฟอสเฟต

ประมาณร้อยละ 60 ของขั้นตอนของโมเลกุล DNA นั้นทำจากอะดีนีน - ไทมีนไนโตรเจน ประมาณ 40 เปอร์เซ็นต์ของขั้นทำจากฐาน guanine-cytosine ถ้าแบบจำลองมี 10 รุ่งขั้นหกขั้นจะเป็นอะดีนีน - ไทมีนและที่เหลืออีกสี่ตัวจะเป็น guanine-cytosine rungs

อะดีนีนและไทมีนเชื่อมต่อกับพันธะไฮโดรเจนสองพันธะขณะที่กัวนีนและไซโตซีนเชื่อมต่อกับพันธะไฮโดรเจนสามพันธะ Adenine ไม่สามารถเชื่อมต่อกับ cytosine และ guanine ไม่สามารถเชื่อมต่อกับ thymine ได้เนื่องจากพันธะไฮโดรเจนไม่ตรงกัน (ดูแหล่งข้อมูลเพื่อฝึกฝนการสร้างโมเลกุล DNA) Adenine และ Guanine เป็นโมเลกุลสองวงซึ่งมีขนาดใหญ่กว่าโมเลกุลของ Thymine และ Cytosine Single-Ring เล็กน้อย

Rungs ไนโตรเจนไม่ได้ปรับทิศทางเสมอกับฐานเดียวกันในด้านเดียวกันซึ่งหมายความว่าบางครั้ง Adenine-Thymine Rung จะมี Adenine ทางด้านซ้ายและบางครั้ง Thymine จะอยู่ทางซ้าย Guanine และ cytosine สามารถสลับข้างได้

โมเลกุลดีเอ็นเอเป็นเกลียวคู่ โครงสร้างดูเหมือนบันไดบิดไปมารอบ ๆ แบบจำลองควรสะท้อนรูปร่างนี้

การสร้างแบบจำลองดีเอ็นเอเกลียวคู่

สร้างแบบจำลองดีเอ็นเอด้วยหลอดดูด คำแนะนำเหล่านี้ใช้ประคำสำหรับด้านกระดูกสันหลังและหลอดสำหรับรุ่ง

การเลือกวัสดุ: ลูกปัดสำหรับโมเลกุล Deoxyribose จำเป็นต้องมีเส้นผ่านศูนย์กลางเท่ากับหรือใหญ่กว่าเส้นผ่านศูนย์กลางของฟางเล็กน้อย ลูกปัด Pony ในสองสีเช่นสีขาวและสีดำจะทำงานได้ดี

หุ่นจำลองต้องการวัสดุเชื่อมต่อที่มีความยืดหยุ่นเพียงพอที่จะสานผ่านหลอดและลูกปัดในขณะที่มีความแข็งแรงเพียงพอที่จะเก็บรูปทรงสามมิติของแบบจำลอง น้ำยาทำความสะอาดสายไฟหรือท่ออาจทำงานได้

ใช้หลอดที่ใสหรือโปร่งแสงแล้วใส่น้ำยาทำความสะอาดท่อสีผ่านส่วนที่เป็นฟางเพื่อแยกฐานไนโตรเจนทั้งสี่ ตัวอย่างเช่นใช้สีเหลืองสำหรับ adenine, สีเขียวสำหรับ thymine, สีแดงสำหรับ guanine และสีน้ำเงินสำหรับ cytosine ใช้น้ำยาทำความสะอาดท่อสีขาวหรือสีดำหรือสายลวดร้านดอกไม้สำหรับแบ็คโบน

สร้างกระดูกสันหลัง: โมเลกุล DNA มีสองด้านหรือแบ็คโบน สานลวดทำความสะอาดท่อหรือร้านดอกไม้ผ่านลูกปัดลูกกลมสีดำและสีขาวสลับเพื่อสร้างความยาวของลูกปัดอย่างน้อย 20 เม็ดยาว (10 สีขาวและ 10 เม็ดสีดำ) ทำซ้ำเพื่อสร้างฝั่งตรงข้าม คุณอาจเพิ่มเม็ดบีดพิเศษสองสามเส้นบนกระดูกสันหลังแต่ละอัน

สร้างรุ่ง: สร้างคู่เบสอะดีนีน - ไทมีนหกคู่และคู่เบสกัวนีน - ไซโตซีนสี่คู่เพื่อสร้างแบบจำลองแสดงอัตราส่วนที่เหมาะสมของอะดีนีน - ไทมีนและกัวนีน - ไซโตซีน เริ่มต้นด้วยการตัดฟาง 10 ส่วนที่มีความยาว 2 นิ้ว

คู่ฐาน Adenine-thymine

ปิดกึ่งกลางเล็กน้อยตัดส่วนฟางหกส่วนออกจากกันโดยใช้รูปตัว V หรือมุมฉาก

ตัดความยาวท่อขนาด 2 นิ้วหกเหลี่ยมของน้ำยาทำความสะอาดสีเหลือง (สำหรับอะดีนิน) และตัวทำความสะอาดท่อสีเขียวขนาด 2 นิ้วจำนวนหกชิ้น (สำหรับไทมีน)

เกลียวน้ำยาทำความสะอาดท่อสีเหลืองผ่านชิ้นฟางที่ยาวขึ้นและตัวทำความสะอาดท่อสีเขียวผ่านชิ้นฟางที่สั้นกว่า

คู่ฐาน Guanine-cytosine

ปิดกึ่งกลางเล็กน้อยตัดส่วนที่เหลืออีกสี่ส่วนออกจากกันโดยใช้การตัดแบบโค้ง

ตัดความยาวท่อขนาด 2 นิ้วสี่นิ้วของน้ำยาทำความสะอาดท่อสีแดง (สำหรับ guanine) และตัวทำความสะอาดท่อสีน้ำเงินขนาด 2 นิ้วสี่ตัว (สำหรับ cytosine)

ด้ายน้ำยาทำความสะอาดท่อสีแดงผ่านชิ้นฟางยาวและน้ำยาท่อสีฟ้าผ่านชิ้นฟางที่สั้นกว่า

เชื่อมต่อขั้นตอน: ใช้คีมที่มีจมูกเพื่อประกอบ rungs และ model

จับคู่ปลายตัดที่มีมุมของอะดีนีนและส่วนที่เป็นไธโอมีนฟาง ใช้คีมเพื่อสร้างตะขอที่ส่วนท้ายของส่วนทำความสะอาดท่อ ขอให้ทำความสะอาดท่อสีเหลืองและสีเขียวเข้าด้วยกันแล้วปิดตะขอเพื่อยึดชิ้นส่วนเข้าด้วยกัน ทำซ้ำเพื่อสร้างอะดีนีน - ไทมินหกอัน

จับคู่ปลายโค้งของ guanine และส่วน cytosine straw ขอให้ทำความสะอาดท่อสิ้นสุดลงและเชื่อมต่อกับที่คุณทำกับขั้นสูงของอะดีนีน - ไทมีน ทำซ้ำเพื่อสร้าง rungs guanine-cytosine สี่ตัว

การประกอบแบบจำลอง

ตัดสินใจว่าเม็ดบีดสีขาวหรือดำในแกนหลักจะเป็นตัวแทนของโมเลกุล Deoxyribose ฐานจะติดกับสีนั้นเท่านั้น

สำหรับตัวอย่างนี้ให้ลูกปัดสีดำแสดงถึง deoxyribose แนบปลายด้านหนึ่งของ adenine-thymine หรือ guanine-cytosine rung โดยการแทรกปลายของน้ำยาทำความสะอาดท่อผ่านลวดหรือน้ำยาทำความสะอาดท่อที่ถือลูกปัด คุณควรมีความยาวท่อทำความสะอาดส่วนเกิน

ทำซ้ำการเชื่อมต่อแต่ละรุ่งกับลูกปัดสีดำจนกระทั่งทั้ง 10 rungs ติดอยู่กับกระดูกสันหลังด้านหนึ่ง โปรดจำไว้ว่าฐาน adenine หรือ guanine ไม่ทั้งหมดจะแนบไปกับด้านเดียวกันของแบบจำลอง

เชื่อมต่อปลายตรงข้ามของแต่ละรุ่งกับลูกปัดสีดำบนกระดูกสันหลังส่วนที่สอง แบบจำลองควรมีลักษณะเหมือนบันได

จัดวางตำแหน่งขั้นสูงเพื่อให้เข้าแถว ขันปลายท่อน้ำยาให้แน่นเพื่อให้โมเดลมีความเสถียรและค่อนข้างแข็ง ตัดปลายของน้ำยาทำความสะอาดท่อถ้าจำเป็น

ทำแบบบิด

โมเลกุลดีเอ็นเอเป็นเกลียวคู่ หยิบแบบจำลองและบิดแบบจำลองเป็นเกลียวอย่างระมัดระวัง

ติดป้ายชื่อรุ่น

ระบุเลเบลโมเดลหรือสร้างคีย์เพื่อระบุอิลิเมนต์ของโมเดล